9X01 / NOTHING IMPORTANT HAPPENNING DAY / СЕГОДНЯ НЕ СЛУЧИТСЯ НИЧЕГО ВАЖНОГО
Подруга Доггетта по морской службе, используя свою сверхъестественную способность находиться под водой, топит по неизвестным причинам двух человек. В результате предпринятого расследования, Скиннер и Доггетт попадают на завод по переработке отходов, где внезапное появление бывшей сослуживицы подвергает жизнь агента смертельной опасности…

9×02 / NOTHING IMPORTANT HAPPENNING DAY II / СЕГОДНЯ НЕ СЛУЧИТСЯ НИЧЕГО ВАЖНОГО II
Доггетт узнает от Макмахон, что она является биологическим роботом, продуктом военной науки пятидесятых. Тайна, которую открывает бывшая боевая подруга агента, заставляет Доггетта и Скалли пойти на крайние меры…

9×03 / DEMONICUS / САТАНА
Доггетт и Рейес расследует странные обстоятельства убийства женщины собственным мужем, принявшего свою жену за незваного гостя, проникшего в дом. Агенты приходят к выводу, что супруги стали жертвами сатанинского культа:

9×04 / 4-D / 4-D
Убийца не остановится ни перед чем, чтобы убить Доггета и Рейес. Или нет? Единственное, в чем можно не сомневаться, так это в том, что он на шаг впереди агентов.

9×05 / LORD OF THE FLIES / ПОВЕЛИТЕЛЬ МУХ
Во время записи трюков для кабельного шоу погибает подросток. Но причиной его гибели может оказаться не просто неудачное падение.

9×06 / TRUST NO 1 / НЕ ДОВЕРЯЙ НИКОМУ
Скалли надеется на возвращение Малдера, когда информация, полученная от незнакомца, заставляет ее задуматься о том, что заставило Малдера скрыться. А ее доверие незнакомцу может стоить Малдеру жизни.

9×07 / JOHN DOE / ДЖОН ДОУ
Не зная ни своего имени, ни своего прошлого, Доггетт бродит по пыльным улицам мексиканского городка. Он пытается восстановить свое прошлое. Как он потерял память. И как оказался в незнакомом городе.

9×08 / HELLBOUND / ИДУЩИЙ В АД
Убежденная, что перед ней очередное дело из серии секретных материалов, Рейес ищет убийцу, который заживо сдирает людей кожу. Но агента не покидает ощущение странной личной причастности к делу.

9×09 / PROVENANCE / ИСТОЧНИК
Заполучив рисунки с поверхности космического корабля, ФБР прячет их от сотрудников отдела секретные материалы, и есть только один человек, который может объяснить значение таинственных символов – Скалли.

9×10 / PROVIDENCE / ПРОВИДЕНИЕ
При пересечении границы погибает нарушитель. Руководство ФБР пытается скрыть от Скалли, что погибший является агентом, внедрённым в секту, поклоняющуюся культу НЛО. В это время религиозные фанатики готовят очередную страшную акцию…

9×11 / AUDREY PAULEY / ОДРИ ПОЛЕЙ
Доггет и Скалли ищут ответы на вопросы, как спасти жизнь Рейс после ранения в ужасной автокатастрофе. Однако, Рейс также пытается остаться в живых в неизвестности между жизнью и смертью.

9×12 / UNDERNEATH / НИЗИНА
Когда случай из его прошлого повторяется, Доггет твердо стоит на своем первоначальном заключении, которое не совпадает с теорией Скалли и Рейс.

9×13 / IMPROBABLE / НЕВЕРОЯТНЫЙ
Агенты полагаются на собственные познания в нумерологии и таинственного незнакомца, помогающего поймать серийного убийцу.

9×14 / SCARY MONSTERS / СТРАШНЫЕ МОНСТРЫ
Агенты расследуют загадочную смерть женщины. Скалли обнаруживает необъяснимое сходство гибели женщины и ее кота. Малолетний сын погибшей утверждает, будто его мать и кота убили монстры. Доггетт и Рейес уверены, что жизнь мальчика под угрозой. Агентам сначала даже не приходит в голову, что именно мальчик представляет опасность для окружающих…

9×15 / JUMP THE SHARK / ПРЫЖОК АКУЛЫ
На Карибских островах с яхты Морриса Флетчера злоумышленники похищают девушку, а судно взрывают. Моррис настаивает на участии в расследовании Рейес и Доггетта. Пострадавшему удается заинтересовать агентов, которые надеются с его помощью выйти на совершенного солдата. В ходе следствия выявляются факты, ставящие под сомнение невиновность жертвы…

9×16 / WILLIAM / УИЛЬЯМ
Доггетт задерживает в своём офисе незнакомца с обезображенным лицом, утверждающего, что его уродство – последствие провалившегося правительственного эксперимента по превращению его в инопланетянина. Результат взятого у незнакомца теста на ДНК не только не вносит ясности, но создаёт ещё большую путаницу. Оказавшись в квартире Скалли, неизвестный делает маленькому Уильяму инъекцию…

9×17 / RELEASE / ВЫПУСК
Доггетт по анонимной наводке находит замурованный в стене труп. Скалли обнаруживает сходство почерка преступления с убийством сына Доггетта, совершенного 9 лет назад. Молодой курсант ФБР помогает безутешному отцу выйти на след предполагаемого злоумышленника. Однако скоро выясняется, что курсант учится в академии под вымышленной фамилией…

9×18 / SUNSHINE DAYS / СОЛНЕЧНЫЕ ДНИ
Происходят два загадочных убийства в точной копии дома Бредли из популярного телесериала. Агенты пытаются найти связать между этими преступлениями и человеком, живущим в доме. Доггету и Рейес удается выяснить, что владелец особняка Оливер Мартин обладает психокинетическими способностями. Пользуясь удивительным даром, он подвергает себя смертельной опасности…

9×19-9×20 / The Truth / ПРАВДА
Пытаясь проникнуть в военный засекреченный комплекс, Малдер убивает человека. Бывшего агента ФБР судит военный трибунал. Скиннер, выступающий адвокатом подзащитного, чтобы оправдать Малдера, пытается доказать существование инопланетного заговора внутри правительства. Сам Малдер отказывается давать показания, которые могли бы спасти его жизнь…
Несмотря на доказательства Доггета и других свидетелей защиты, что человек, убитый Малдером, на самом деле является суперсолдатом, которого нельзя уничтожить, Малдера, тем не менее приговаривают к смертной казни. Скиннер и Доггет помогают Малдеру бежать вместе со Скалли. Но вместо того, чтобы бежать из страны, бывший агент ФБР отправляется на поиски истины…